Algunos clubes entraron en crisis económica por los altos sueldos que pagaban a los futbolistas extranjeros, así como por la pérdida de patrocinadores, y el punto de inflexión fue la desaparición del Yokohama Flügels en enero de 1999, real sociedad tienda online absorbido por sus rivales del Yokohama Marinos. Los pocos futbolistas japoneses que jugaban fuera también regresaron para competir en el nuevo torneo, siendo el más celebre Kazuyoshi Miura en el Verdy Kawasaki.