El 27 de febrero de 2013 en la Copa Libertadores le marcó al equipo colombiano Millonarios con una volea de una cruz. El 26 de enero de 2011 en un partido válido por la Copa Italia contra la Sampdoria lejos de casa, anotó dos goles, lo que lleva al Milan a las semifinales de la competición. El 7 de noviembre de 2011, los periódicos en Inglaterra publicaron el interés del Arsenal en el jugador brasileño para enero de 2012. Los gunners estarían dispuestos a pagar alrededor de €40 millones. El 19 de noviembre de 2011, como se esperaba, Pato volvió a jugar en el partido contra la Fiorentina. El juego terminó empatado 2-2 y se fue a los penales, donde el Milan falló todos los lanzamientos, incluido el de Pato. Participó en el juego durante 20 minutos, golpeando una pelota en el poste. El primer gol a los 17 de la primera parte y el segundo gol a los 28 minutos, después de una asistencia de Ronaldinho.

Pato participó en todos los goles, tuvo una asistencia y un gol tras un pase desde el centro del campo. En una victoria por 3-0 en el partido de vuelta, Pato marcó el primer gol del partido, después de una asistencia procedente de Maicon. El 14 de agosto de 2020, habiendo sido reemplazado a los 113′ minutos de partido, se retiró del fútbol profesional. En su primer partido liguero, disputado el 29 de agosto ante el Real Racing Club de Santander, anotó el tercer gol de su equipo para poner el 3-0 definitivo en el marcador. El 31 de diciembre de 1904 jugaron su primer partido contra un club internacional: el Stade Olympien des Étudiants de Toulouse francés finalizando con un marcador de 7-2 para los locales. Debutó en Primera División el 16 de diciembre de 1990 frente al Cádiz en el Camp Nou. Tuvo actuación destacada contra el FC Barcelona, el 13 de septiembre de 2011 en el Camp Nou. Dicha solicitud fue desestimada por el Tribunal Nacional Antidopaje de Italia el 29 de septiembre.

El 21 de septiembre de 2011, en el partido contra el Udinese en el estadio San Siro, dejó el campo después de 20 minutos del primer tiempo, otra vez con una lesión en el muslo herido. En el último partido de la temporada, el 22 de mayo de 2011, sufrió otra lesión, esta vez en el hombro tras sufrir una falta del jugador Cristian Zapata del Udinese. El Milan ganó el partido 2-0, y el primer gol llegó después de una falta penal sufrida Pato y ejecutada por Zlatan Ibrahimović. El club catalán hizo una oferta que consistía en sustituir a Zlatan Ibrahimović por el jugador brasileño, pero el cuadro rossonero la rechazó rápidamente. En agosto de 2011, el Chelsea volvió a tratar de contratar al joven delantero brasileño, y los blues estuvieron dispuestos a pagar alrededor de 85 millones de euros, pero la propuesta fue otra vezrechazada por los rossoneros.

Su debut oficial se dio el 20 de agosto de 2009 en el empate 1-1 frente a Club Atlético Vélez Sarsfield por la Copa Sudamericana, siendo ovacionado por los simpatizantes. «El Atlético da comienzo a su penitencia». A la edad de 15 años se incorporó a la sexta división del club Defensor Sporting y luego pasó en el 2003 al Club Atlético Cerro, de la primera división del fútbol uruguayo. Sumados al equipo finalista de la anterior edición de la Copa de Campeones, el Milan cerró los años ’50 ganando su séptimo campeonato (tras de un apasionante cara a cara con la Fiorentina) y el cuarto de aquella década. Finalmente, Joaquín Peiró se retiraría como entrenador en 2004 en el mismo conjunto en el que había iniciado su carrera como jugador profesional cincuenta años antes: el Real Murcia. Finalmente, el Manchester City obtuvo la 3ª posición en la Premier League.